En dépit de la forte valeur écologique, économique, culturelle et sociale qu’ils représentent, les milieux humides ont longtemps été considérés comme hostiles à l’Homme et ont par conséquent été « assainies », drainées et comblées au fil des siècles.

Leur superficie n’a cessé de régresser et leur état s’est profondément dégradé, notamment au cours de la seconde moitié du 20^ème siècle durant laquelle elles ont souvent été converties en zones agricoles, urbaines ou industrielles, ou remplacées par des milieux humides artificiels.

De nos jours, la plupart des milieux humides sont encore mises en péril par l’intensification de l’agriculture, forte consommatrice d’eau et d’espace et source de pollution organique, les aménagements hydrauliques, le changement climatique, et l’introduction de nouvelles espèces.